A Fullmetal Alchemist című anime  egyik központi eleme, aminek megszerzése, vagy létrehozása számos főszereplő cselekvő indoka. A Bölcsek Kövének legendáján alapul, ami a hagyomány szerint képes volt arannyá változtatni más elemeket, illetve birtokosát örök élettel ruházta fel. A Fullmetal Alchemist-ben szereplő kő hasonlóképpen legendás tétel, ami megengedi a tulajdonosának, hogy megkerülje az Egyenértékűség Törvényét. A történet anime adaptációjában léteznek úgynevezett „Vörös Kövek”, amikre esetenként a „Tökéletlen Bölcsek Köve” és a „Hamis Bölcsek Köve” kifejezést is használják. Ezek egy folyékony mérgező anyagból, a Vörös Vízből transzmutálhatók. Mivel ez a fajta kő nem teljes, így kisebb értékű a valódi kőnél és előállítani is könnyebb. A használóját képességei kiterjesztéséhez segítheti. Mivel sokszor térnek vissza mérgező hatására, az anyaga valószínűleg cinnabarit, más néven higanyszulfid.

• A „Vörös Kő” kikristályosítható az erősen mérgező „Vörös Vízből”. A víz halálos párát bocsát ki, ami szélesen szétterülhet. Kristályosításához a legkönnyebb módszer az anyag bejuttatása egy terhes nő méhébe, majd szilárd formában sebészileg eltávolítani, megölve az anyát és a magzatot.
• A lassú és drága kémiai eljárás szintén lehetséges, de az így nyert Kövek rendszerint nagyon kicsik és nem túl hasznosak.
• Az igazi Kőnek nagy ára van. Csak egy mesteralkimista képes előállítani nyersanyagként emberi életek százait, vagy ezreit feláldozva. A sorozatban Hohenheim arra használja a Vörös Vizet, hogy megindítsa az eljárást és létrehozza a Bölcsek Kövét. A pestisjárványban meghaltak életei és azok, akiket boszorkányságért ítéltek halálra, mind a Kő előállítására szolgáltak. A Fullmetal Alchemist anime történetében csak Hohenheim és a heges arcú, ishbali Sebzett voltak képesek végrehajtatni ezt a rettenetes bravúrt.

A megszerzett Kőnek nincs meghatározott alakja. Az első kő izzó gyémánthoz volt hasonló, ami nem nagyobb egy teniszlabdánál. A későbbiekben pedig Sebzett karja vált Tökéletlen Bölcsek Kövévé, ami Alphonse Elric páncél-testében vált a Teljes Kővé. A transzmutáció azonban nem változtatta meg a fiú páncélos megjelenését, kivéve a sérült páncél belsejéből előderengő vörös fényt, valamint a vörös, tetoválásszerű jeleket a testén, amik korábban Sebzett karján voltak láthatók. Ezek a jelek mindannyiszor felragyognak, amikor Alphonse transzmutációs kör sugarába kerül. Azonban még ez az alak sem volt teljesen tiszta a kisfiú testét „alkotó” fém miatt, és csak miután Falánk elfogyasztotta, vált valódi Bölcsek Kövévé.